Unités mixtes de recherche
Unités propres VetAgro Sup
Activités Scientifiques Individuelles (ASI) associées à 7 autres unités
- CRNL – Centre de Recherche en Neurosciences de Lyon
- CleRMa – Clermont Recherche Management
- GDEC – Génétique diversité et écophysiologie des céréales
- INMG-UMR PGNM – Physiopathologie et Génétique du Neurone et du Muscle
- IVPC – Infections virales et pathologie comparée
- CIRI – Centre international de recherche en infectiologie
- MECADEV – Mécanismes adaptatifs et évolution
Présentation
Les activités de recherche du laboratoire écologie microbienne (LEM) se placent au carrefour des domaines de l’écologie et de la microbiologie.
L’écologie microbienne a pour objectifs d’étudier la physiologie des microorganismes et l’influence de leurs activités sur les autres organismes et sur l’environnement en général, et, de façon symétrique, d’étudier l’impact des facteurs biotiques et abiotiques du milieu sur ces microorganismes, de l’échelle individuelle aux communautés présentes dans un écosystème. Travaillant sur quelques fonctions-clés pour le fonctionnement de l’écosystème global comme la dénitrification ou la fixation d’azote, l’UMR Ecologie microbienne décrit les populations microbiennes impliquées, leur diversité et leurs fluctuations, les effets de ces populations sur la fonction considérée et surtout, le rôle de ces fonctions dans l’avantage sélectif (« fitness »). A un autre niveau conceptuel, les outils utilisés par l’unité relèvent de la microbiologie, que celle-ci soit physiologique, génétique, taxonomique ou biochimique.
Pour plus d’informations, vous pouvez visiter le site web de l’UMR Ecologie Microbienne.
Directeur de l’UMR :
Sylvie Nazaret (CNRS)
Directeurs-adjoints de l’UMR :
Florence WISNIEWSKI (UCBL)
Xavier Le Roux (INRAE)
Correspondant VetAgro Sup :
Delphine Sergentet
Axes de recherche
L’UMR Ecologie Microbienne comporte 8 équipes de recherche travaillant sur des thématiques variées :
- Symbiose Actinorhizienne
- Interactions Microeucaryotes-Bactéries-Archées
- Rhizosphère
- Diversité et adaptation des bactéries phytopathogènes
- Diversité fonctionnelle microbienne et Cycle de l’Azote
- Bactéries Pathogènes Opportunistes et Environnement
- Dynamique Microbienne et Transmission Virale
- Multi-résistance Environnementale et Efflux Bactérien